Alignment of NLV strains where Setting is Hotel


            0         10        20        30        40        50        
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HILLINGDON  GCTGACTCTCTGTGCTTTGTCTGAAGTCACCAACCTGTCTCCTGACATCGTGCAGGCAAA
MELKSHAM    CCTCACCCTATGTGCTCTTTCTGAAGTCACAGACCTTTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
HARROW_II   CCTAACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
HAWAII_Rot  CCTCACACTCTGCGCACTCTCTGAAACTACAAATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
BRISTOL_Gr  TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCTCCTGACATCATACAGGCTAA
HAWAII_Ste  TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATTTATCTCCTGACATCATCCAAGCAAA
TORONTO_24  GCTTACTCTGTGTGCCCTTTCTGAAGTGACAGGACTAGGCCCCGACATCATACAAGCTAA
AMSTERDAM_  CCTGACCCTCAGTGCTATGTCCGAGGTCTCTGGTCTTTCACCTGAGGTTGTGCAAGCCAA
LEEDS_Guer  CCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTTTCACCAGATGTTGTCCAAGCTCA
SOUTHAMPTO  GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTTACTGGCCTATCACCAGATGTTATTCAGTCCAT
VALETTA     GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAGTCCCA
DESERT_SHI  CCTAACTCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGTTTGTCCCCTGATGTAATACAGTCACA
KSR2A/2001  CTATACTTTGTGTGCCTTATCAGAAGTTACTGGCTTGGCCCCTGATGTGATACAGTCACA
GHANA       AATCACCCTTTGTGCCCTCTCTGAAGTCACCGGACTTTCTCCTGATGTGATACAGTCACA
NORWALK_Ro  AATTACCCTCTGTGCACTCTCTGAAGCCACCGGTCTGTCACCTGATGTAGTGCAATCCAT
ALPHATON_S  CGTCACTCTCACATCCATGGCTGAGGCCACTGGCCTGGACCCTGACATCGTCCAGGCTAA
2114537     AATTACCCTCTGTGCACTCCCTGAAGCCACCGGTCTGTCACCTGATGTAGTGCAATCCAT
2205512     CCTAACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2136350     TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATTTATCTCCTGACATCATCCAAGCAAA
2163469     GATAACTTTGTGCGCCCTCTCTGAGGTGACTGGCCTGTCACCAGATGTTAT.CAGTCCAT
2114937     CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGCCTTCCACCAGATGTTGTCCAAGCTCA
2240260     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2240262     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2233455     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2041392     TCTAACTCTGTGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCTTGTCCCCTGATGTGATACAATCACA
2153989     CCTAACTCTGTGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCTTGTCCCCTGATGTGATACAATCACA
9945418     CCTAACTCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCTTATCCCCTGATGTGATACAATCACA
2144934     ACTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCGCCAGATGTTGTCCAAGCCCA
2114876     CCTCACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATCTCTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
9643801     CCTCACTCTTTGTGCACTCTCTGAGGTGACAAATTTGTCCCCTGACACCATCCAAGCAAA