Alignment of NLV strains where Country is Mediterranean


            0         10        20        30        40        50        
            |---------|---------|---------|---------|---------|---------
HILLINGDON  GCTGACTCTCTGTGCTTTGTCTGAAGTCACCAACCTGTCTCCTGACATCGTGCAGGCAAA
MELKSHAM    CCTCACCCTATGTGCTCTTTCTGAAGTCACAGACCTTTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
HARROW_II   CCTAACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
HAWAII_Rot  CCTCACACTCTGCGCACTCTCTGAAACTACAAATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
BRISTOL_Gr  TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCTCCTGACATCATACAGGCTAA
HAWAII_Ste  TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATTTATCTCCTGACATCATCCAAGCAAA
TORONTO_24  GCTTACTCTGTGTGCCCTTTCTGAAGTGACAGGACTAGGCCCCGACATCATACAAGCTAA
AMSTERDAM_  CCTGACCCTCAGTGCTATGTCCGAGGTCTCTGGTCTTTCACCTGAGGTTGTGCAAGCCAA
LEEDS_Guer  CCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTTTCACCAGATGTTGTCCAAGCTCA
SOUTHAMPTO  GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTTACTGGCCTATCACCAGATGTTATTCAGTCCAT
VALETTA     GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAGTCCCA
DESERT_SHI  CCTAACTCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGTTTGTCCCCTGATGTAATACAGTCACA
KSR2A/2001  CTATACTTTGTGTGCCTTATCAGAAGTTACTGGCTTGGCCCCTGATGTGATACAGTCACA
GHANA       AATCACCCTTTGTGCCCTCTCTGAAGTCACCGGACTTTCTCCTGATGTGATACAGTCACA
NORWALK_Ro  AATTACCCTCTGTGCACTCTCTGAAGCCACCGGTCTGTCACCTGATGTAGTGCAATCCAT
ALPHATON_S  CGTCACTCTCACATCCATGGCTGAGGCCACTGGCCTGGACCCTGACATCGTCCAGGCTAA
2251513     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2251292     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2261315     TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2261301     TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2256283     CCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2266024     TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2234066     TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAGATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2255440     CTTAACCCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCTTGTCCCCAGATGTGATACAATCGCA
2251295     CTTAACCCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCTTGTCCCCAGATGTGATACAATCGCA
2251293     CTTAACCCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCTTGTCCCCAGATGTGATACAATCGCA