Alignment of NLV strains where Setting is Military


            0         10        20        30        40        50
            |---------|---------|---------|---------|---------|
HILLINGDON  GCTGACTCTCTGTGCTTTGTCTG.AAGTCACCAACCTGTCTCCT.GACATC
MELKSHAM    CCTCACCCTATGTGCTCTTTCTG.AAGTCACAGACCTTTCTCCT.GACATT
HARROW_II   CCTAACACTATGTGCGCTGTCTG.AAGTCACAGATCTGTCCCCT.GACATC
HAWAII_Rot  CCTCACACTCTGCGCACTCTCTG.AAACTACAAATCTGTCCCCT.GACATC
BRISTOL_Gr  TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTG.AAGTTACAAACTTGTCTCCT.GACATC
HAWAII_Ste  TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTG.AAGTGACAAATTTATCTCCT.GACATC
TORONTO_24  GCTTACTCTGTGTGCCCTTTCTG.AAGTGACAGGACTAGGCCCC.GACATC
AMSTERDAM_  CCTGACCCTCAGTGCTATGTCCG.AGGTCTCTGGTCTTTCACCT.GAGGTT
LEEDS_Guer  CCTAACTTTGAGTGCAATGGCAG.AAGTGTCAGGTCTTTCACCA.GATGTT
SOUTHAMPTO  GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTG.AGGTTACTGGCCTATCACCA.GATGTT
VALETTA     GATCACATTGTGTGCCATGTCTG.AAGTCACAGGCTTATCACCC.GATGTC
DESERT_SHI  CCTAACTCTATGTGCACTGTCAG.AAGTCACTGGTTTGTCCCCT.GATGTA
KSR2A/2001  CTATACTTTGTGTGCCTTATCAG.AAGTTACTGGCTTGGCCCCT.GATGTG
GHANA       AATCACCCTTTGTGCCCTCTCTG.AAGTCACCGGACTTTCTCCT.GATGTG
NORWALK_Ro  AATTACCCTCTGTGCACTCTCTG.AAGCCACCGGTCTGTCACCT.GATGTA
ALPHATON_S  CGTCACTCTCACATCCATGGCTG.AGGCCACTGGCCTGGACCCT.GACATC
2322813     GATAACTCTATGTGCCCTCTCTG.AGGTGACTGGTCTGTCACCA.GATGTT
2322792     GATAACTTTATGTGCCCTCTCTG.AGGTGACTGGTCTGTCACCA.GATGTT
2257195     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTG.AAGTTACAAATCTGTCCCCT.GACATC
2235940     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTG.AAGTTACAAATCTGTCCCCT.GACATC
2322804     CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAG.AAGTGTCAGGTCTCTCGCCA.GATGTT
2234290     GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGTAGGTGACTGGCCTGTCACCCAGATGTN
2256992     CTTAACCCTATGTGCACTGTCAG.AAGTCACTGGCTTGTCCCCA.GATGTG
Argus-1/20  CTACACTTTGTGTGCCCTATCAG.AGGTCACTGGTTTGGCTCCC.GATGTA
2322796     CTACACTTTGTGTGCCCTATCAG.AGGTCACTGGTTTGGCTCCC.GATGTA
2234636     TCTCACTCTTTGTGCACTTTCTG.AAGTCACGGACCTGTCTCCC.GACATT
2236080     TCTCACTCTTTGTGCACTTTCTG.AAGTCACGGACCTGTCTCCC.GACATT
2234289     TCTCACTCTTTGTGCACTTTCTG.AAGTCACGGACCTGTCTCCC.GACATT
2233859     TCTCACTCTTTGTGCACTTTCTG.AAGTCACGGACCTGTCTCCC.GACATT
2160120     CATTACCCTTAGTGCAATGGCAG.AAGTTTCTGGTCTCTCCCCA.GATGTG
2049022     CCTAACTCTGTGTGCACTGTCAG.AAGTCACTGGCTTGTCCCCT.GATGTG