Alignment of NLV strains where Setting is Military
0 10 20 30 40 50
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HILLINGDON GCTGACTCTCTGTGCTTTGTCTG.AAGTCACCAACCTGTCTCCT.GACATC
MELKSHAM CCTCACCCTATGTGCTCTTTCTG.AAGTCACAGACCTTTCTCCT.GACATT
HARROW_II CCTAACACTATGTGCGCTGTCTG.AAGTCACAGATCTGTCCCCT.GACATC
HAWAII_Rot CCTCACACTCTGCGCACTCTCTG.AAACTACAAATCTGTCCCCT.GACATC
BRISTOL_Gr TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTG.AAGTTACAAACTTGTCTCCT.GACATC
HAWAII_Ste TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTG.AAGTGACAAATTTATCTCCT.GACATC
TORONTO_24 GCTTACTCTGTGTGCCCTTTCTG.AAGTGACAGGACTAGGCCCC.GACATC
AMSTERDAM_ CCTGACCCTCAGTGCTATGTCCG.AGGTCTCTGGTCTTTCACCT.GAGGTT
LEEDS_Guer CCTAACTTTGAGTGCAATGGCAG.AAGTGTCAGGTCTTTCACCA.GATGTT
SOUTHAMPTO GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTG.AGGTTACTGGCCTATCACCA.GATGTT
VALETTA GATCACATTGTGTGCCATGTCTG.AAGTCACAGGCTTATCACCC.GATGTC
DESERT_SHI CCTAACTCTATGTGCACTGTCAG.AAGTCACTGGTTTGTCCCCT.GATGTA
KSR2A/2001 CTATACTTTGTGTGCCTTATCAG.AAGTTACTGGCTTGGCCCCT.GATGTG
GHANA AATCACCCTTTGTGCCCTCTCTG.AAGTCACCGGACTTTCTCCT.GATGTG
NORWALK_Ro AATTACCCTCTGTGCACTCTCTG.AAGCCACCGGTCTGTCACCT.GATGTA
ALPHATON_S CGTCACTCTCACATCCATGGCTG.AGGCCACTGGCCTGGACCCT.GACATC
2322813 GATAACTCTATGTGCCCTCTCTG.AGGTGACTGGTCTGTCACCA.GATGTT
2322792 GATAACTTTATGTGCCCTCTCTG.AGGTGACTGGTCTGTCACCA.GATGTT
2257195 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTG.AAGTTACAAATCTGTCCCCT.GACATC
2235940 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTG.AAGTTACAAATCTGTCCCCT.GACATC
2322804 CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAG.AAGTGTCAGGTCTCTCGCCA.GATGTT
2234290 GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGTAGGTGACTGGCCTGTCACCCAGATGTN
2256992 CTTAACCCTATGTGCACTGTCAG.AAGTCACTGGCTTGTCCCCA.GATGTG
Argus-1/20 CTACACTTTGTGTGCCCTATCAG.AGGTCACTGGTTTGGCTCCC.GATGTA
2322796 CTACACTTTGTGTGCCCTATCAG.AGGTCACTGGTTTGGCTCCC.GATGTA
2234636 TCTCACTCTTTGTGCACTTTCTG.AAGTCACGGACCTGTCTCCC.GACATT
2236080 TCTCACTCTTTGTGCACTTTCTG.AAGTCACGGACCTGTCTCCC.GACATT
2234289 TCTCACTCTTTGTGCACTTTCTG.AAGTCACGGACCTGTCTCCC.GACATT
2233859 TCTCACTCTTTGTGCACTTTCTG.AAGTCACGGACCTGTCTCCC.GACATT
2160120 CATTACCCTTAGTGCAATGGCAG.AAGTTTCTGGTCTCTCCCCA.GATGTG
2049022 CCTAACTCTGTGTGCACTGTCAG.AAGTCACTGGCTTGTCCCCT.GATGTG