Alignment of NLV strains where Setting is Nursing Home
0 10 20 30 40 50
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HILLINGDON GCTGACTCTCTGTGCTTTGTCTGAAGTCACCAACCTGTCTCCTGACATCGTGCAGGCAAA
MELKSHAM CCTCACCCTATGTGCTCTTTCTGAAGTCACAGACCTTTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
HARROW_II CCTAACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
HAWAII_Rot CCTCACACTCTGCGCACTCTCTGAAACTACAAATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
BRISTOL_Gr TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCTCCTGACATCATACAGGCTAA
HAWAII_Ste TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATTTATCTCCTGACATCATCCAAGCAAA
TORONTO_24 GCTTACTCTGTGTGCCCTTTCTGAAGTGACAGGACTAGGCCCCGACATCATACAAGCTAA
AMSTERDAM_ CCTGACCCTCAGTGCTATGTCCGAGGTCTCTGGTCTTTCACCTGAGGTTGTGCAAGCCAA
LEEDS_Guer CCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTTTCACCAGATGTTGTCCAAGCTCA
SOUTHAMPTO GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTTACTGGCCTATCACCAGATGTTATTCAGTCCAT
VALETTA GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAGTCCCA
DESERT_SHI CCTAACTCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGTTTGTCCCCTGATGTAATACAGTCACA
KSR2A/2001 CTATACTTTGTGTGCCTTATCAGAAGTTACTGGCTTGGCCCCTGATGTGATACAGTCACA
GHANA AATCACCCTTTGTGCCCTCTCTGAAGTCACCGGACTTTCTCCTGATGTGATACAGTCACA
NORWALK_Ro AATTACCCTCTGTGCACTCTCTGAAGCCACCGGTCTGTCACCTGATGTAGTGCAATCCAT
ALPHATON_S CGTCACTCTCACATCCATGGCTGAGGCCACTGGCCTGGACCCTGACATCGTCCAGGCTAA
2116099 TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATTTATCTCCTGACATCATCCAAGCAAA
2110994 TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATTTATCTCCTGACATCATCCAAGCAAA
2131528 TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATTTATCTCCTGACATCATCCAAGCAAA
2123736 TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATTTATCTCCTGACATCATCCAAGCAAA
2116105 TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATTTATCTCCTGACATCATCCAAGCAAA
2048431 CCTGACCCTCAGTGCTATGTCCGAGGTCTCTGGTCTTTCACCTGAGGTTGTGCAAGCCAA
2045584 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2201134 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2052129 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2123326 CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2111001 CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2203976 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2210143 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2206617 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2156021 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2203625 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2210124 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2209262 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2123333 CCTCACACTATGCGCACTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2123339 GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAATCCCA
2123751 GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAATCCCA
2125596 GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAATCCCA
2000040 GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAATCCCA
2233606 GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTGACTGGCCTGTCACCAGATGTTATTCAGTCCAT
2163467 GATAACTTTGTGCGCCCTCTCTGAGGTGACTGGCCTGTCACCAGATGTTATTCAGTCCAT
9928525 CCTCACACTCTGTGCACTCTCTGAAACTACAAATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
9928540 CCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCACCAGATGTTGTCCAAGCTCA
2114536 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2202821 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACCAACTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2216829 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACCAACTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2163485 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGACGTCATACAGGCTAA
2153583 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2203464 TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAATTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2209263 CCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGACATCATACAGGCCAA
2211999 CCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGACATCATACTGGCCAA
2226552 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTCACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2221922 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2252946 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2244249 TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTCACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2260904 TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2252947 TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2129391 CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACCTGTCCCCTGATATCATACAGGCTAA
2051164 CCTGACTCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCTTGTCCCCTGATGTGATACAATCACA
2052128 CCTAACTCTGTGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCTTGTCCCCTGATGTGATACAATCACA
2122049 CCTGACTCTGTGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCTTGTCCCCTGATGTGATACAATCACA
2153841 CCTAACCCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCTTGTCCCCAGATGTGATACAATCACA
2152746 CCTCACACTCTGTGCACTCTCTGAAGTAACAAATCTGTCCCCTGACATTGTCCAGGCAAA
2123327 CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGCCTTTCACCAGATGTTGTCCAAGCTCA
2156866 CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTATCAGGCCTTTCACCAGATGTTGTCCAAGCTCA
2123349 CCTAACCCTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCACCAGATGTTGTCCAAGCCCA
2228100 CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCGCCAGATGTTGTCCAAGCCCA
2152727 CCTGACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCGCCAGATGTTGTCCAAGCCCA
2152748 CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCGCCAGATGTTGTCCAAGCCCA
2152713 CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCGCCAGATGTTGTCCAAGCCCA
2205771 CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCGCCAGATGTTGTCCAAGCCCA
2249797 ACTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCGCCAGATGTTGTCCAAGCCCA
2210118 CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTATCAGGTCTCTCACCAGATGTTGTCCAAGCCCA
9928662 CCTAACTCTATGTGCATTATCAGAAGTCACTGGCTTATCCCCTGATGTGATACAATCACA
2114492 TCTCACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATCTCTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
2048307 AATAACTCTGTGTGCCCTTTCTGAAGTAACTGGTCTGTCACCAGATGTTATCCAGTCCAT
2038436 GATCACGCTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACGGGTTTGTCACCTGATGTCATACAGTCCCA
2045564 AATTACCCTCTGTGCCCTCTCTGAGGTTACTGGACTATCTCCTGATGTAATACAGTCACA