Alignment of NLV strains where Setting is School


            0         10        20        30        40        50       
            |---------|---------|---------|---------|---------|--------
HILLINGDON  CTGACTCTCTGTGCTTTGTCTGAAGTCACCAACCTGTCTCCTGACATCGTGCAGGCAAA
MELKSHAM    CTCACCCTATGTGCTCTTTCTGAAGTCACAGACCTTTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
HARROW_II   CTAACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
HAWAII_Rot  CTCACACTCTGCGCACTCTCTGAAACTACAAATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
BRISTOL_Gr  CTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCTCCTGACATCATACAGGCTAA
HAWAII_Ste  CTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATTTATCTCCTGACATCATCCAAGCAAA
TORONTO_24  CTTACTCTGTGTGCCCTTTCTGAAGTGACAGGACTAGGCCCCGACATCATACAAGCTAA
AMSTERDAM_  CTGACCCTCAGTGCTATGTCCGAGGTCTCTGGTCTTTCACCTGAGGTTGTGCAAGCCAA
LEEDS_Guer  CTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTTTCACCAGATGTTGTCCAAGCTCA
SOUTHAMPTO  ATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTTACTGGCCTATCACCAGATGTTATTCAGTCCAT
VALETTA     ATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAGTCCCA
DESERT_SHI  CTAACTCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGTTTGTCCCCTGATGTAATACAGTCACA
KSR2A/2001  TATACTTTGTGTGCCTTATCAGAAGTTACTGGCTTGGCCCCTGATGTGATACAGTCACA
GHANA       ATCACCCTTTGTGCCCTCTCTGAAGTCACCGGACTTTCTCCTGATGTGATACAGTCACA
NORWALK_Ro  ATTACCCTCTGTGCACTCTCTGAAGCCACCGGTCTGTCACCTGATGTAGTGCAATCCAT
ALPHATON_S  GTCACTCTCACATCCATGGCTGAGGCCACTGGCCTGGACCCTGACATCGTCCAGGCTAA
2203621     ATTACCCTCTGTGCACTCTCTGAAGCCACCGGTCTGTCACCTGATGTAGTGCAATCCAT
9940268     ATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAATCCCA
2149130     ATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAATCCCA
2164238     ATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTGACTGGCCTGTCACCAGATGTTATTCAGTCCAT
2239591     ATAACTTTGTGCGCCCTCTCTGAGGTGACTGGCCTGTCACCAGATGTTATTCAGTCCAT
2206609     CTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2241134     CTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2156851     CTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2160010     CTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2204259     CTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2114494     CTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2133893     CTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCGCCAGATGTTGTCCAAGCCCA
2044850     CTCACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATCTCTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
2155162     CTCACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATCTCTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
2159021     CTCACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATCTCTCTCCTGACATTGTACAGGCCAA
2044855     CTTACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATCTCTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
2045570     CTCACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATCTCTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
2039867     CTCACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATCTCTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
2003148     CTCACCCTTTGTGCACTCTCTGAAGTCACGAACTTGTCCCCTGACATCATACAAGCTAA
2152694     CTCACCCTTTGTGCACTCTCTGAAGTCACGAACCTGTCCCCTGACATCATACAAGCTAA