Alignment of NLV strains where Country is Wales


            0         10        20        30        40        50        
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HILLINGDON  GCTGACTCTCTGTGCTTTGTCTGAAGTCACCAACCTGTCTCCTGACATCGTGCAGGCAAA
MELKSHAM    CCTCACCCTATGTGCTCTTTCTGAAGTCACAGACCTTTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
HARROW_II   CCTAACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
HAWAII_Rot  CCTCACACTCTGCGCACTCTCTGAAACTACAAATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
BRISTOL_Gr  TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCTCCTGACATCATACAGGCTAA
HAWAII_Ste  TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATTTATCTCCTGACATCATCCAAGCAAA
TORONTO_24  GCTTACTCTGTGTGCCCTTTCTGAAGTGACAGGACTAGGCCCCGACATCATACAAGCTAA
AMSTERDAM_  CCTGACCCTCAGTGCTATGTCCGAGGTCTCTGGTCTTTCACCTGAGGTTGTGCAAGCCAA
LEEDS_Guer  CCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTTTCACCAGATGTTGTCCAAGCTCA
SOUTHAMPTO  GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTTACTGGCCTATCACCAGATGTTATTCAGTCCAT
VALETTA     GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAGTCCCA
DESERT_SHI  CCTAACTCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGTTTGTCCCCTGATGTAATACAGTCACA
KSR2A/2001  CTATACTTTGTGTGCCTTATCAGAAGTTACTGGCTTGGCCCCTGATGTGATACAGTCACA
GHANA       AATCACCCTTTGTGCCCTCTCTGAAGTCACCGGACTTTCTCCTGATGTGATACAGTCACA
NORWALK_Ro  AATTACCCTCTGTGCACTCTCTGAAGCCACCGGTCTGTCACCTGATGTAGTGCAATCCAT
ALPHATON_S  CGTCACTCTCACATCCATGGCTGAGGCCACTGGCCTGGACCCTGACATCGTCCAGGCTAA
2006998     GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAGTCCCA
2163584     GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAATCCCA
2046155     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2052129     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2201134     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2208573     CCTAACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2157754     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2164251     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2203651     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2202381     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2208576     CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2162243     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATCTGTCCCCTGACATCATCCAGCGAAA
2240266     GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTGACTGGCCTGTCACCAGATGTTATTCAGTCCAT
2240261     GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTGACTGGCCTGTCACCAGATGTTATTCAGTCCAT
2240264     GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTGACTGGTCTGTCACCAGATGTTATTCAGTCCAT
2010240     GCTCACACTCTGCGCACTCTCTGAAACCACAAATCTGTCCCCTGACATCATCCAGGCAAA
2004025     GATCACATTGTGTGCTATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAATCCCA
2010236     GATCNCATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCTTATCACCCGATGTCATACAATCCCA
2010977     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2208572     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2208577     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2208579     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2234920     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2240263     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2234917     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2240265     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGACATCATACAAGCTAA
9949448     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCTCCTGACATCATACAGGCTAA
2201142     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2202376     TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGATATCATACAGGCTAA
2208570     TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACTTGTCCCCTGATATCATACAGGCTAA
2208581     TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAATTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2203464     TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAATTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2204081     TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAATTTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2240260     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2240262     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
2247170     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATCTGTCCCCTGACATCATACAGGCTAA
9951112     TCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCACCAGATGTTGTCCAAGCTCA
2052128     CCTAACTCTGTGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCTTGTCCCCTGATGTGATACAATCACA
2114301     CCTAACTCTGTGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCTTGTCCCCTGATGTGATACAATCACA
2046027     CCTTACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATCTCTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
2047495     CCTTACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATCTCTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
2035993     CCTTACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATCTCTCTCCTGACATTGTGCAGGCCAA
2208575     ACTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCGCCAGATGTTGTCCAAGCCCA
2201126     ACTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCGCCAGATGTTGTCCAAGCCCA
2201141     ACTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTCTCTCGCCAGATGTTGTCCAAGCCCA
2124798     CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTCACAAGCCTGTCCCCTGATATTATACAGGCCAA
2011266     TCTAACTCTCTGTGCTCTGTCCGAAACCACCAACCTGTCTCCTGACATCATACAGGCAAA
2008792     CCTCACCCTTTGTGCACTCTCTGAAGTCACGAACCTGTCCCCTGACATCATACAAGCTAA
2006992     CCTCACCCTTTGTGCACTCTCTGAAGTCACGAACCTATCCCCTGACATCATACAAGCTAA
9941490     CCTCACCCTTTGTGCACTCTCTGAAGTCACGAACCTGTCCCCTGACATCATACAAGCTAA
9943442     CCTCACCCTTTGTGCACTCTCTGAAGTCACGAACCTGTCCCCTGACATCATACAAGCTAA
9906374     CCTCACCCTTTGCGCACTCTCTGAAGTCACGAACCTGTCCCCTGACATCATACAAGCTAA
9906375     CCTCACCCTTTGCGCACTCTCTGAAGTCACGAACCTGTCCCCTGACATCATACAAGCTAA